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促生長抗生素（AGPs）在養殖業中應用已超過60年，在相當長的一段時間內促進行業發展，但負面作用也非常突出，尤其是細菌的多重耐藥。2006年歐盟全面禁止AGPs在飼料內添加；我國農業農村部第194號公告，自2020年7月1日起，飼料內禁止添加除中藥外AGPs。
2000年Van報道細菌性腸炎可造成肉雞至少5美分/只的經濟損失。肉雞腸道細菌病具體影響包括：
飼料報酬降低10%，屠宰體重減少2-13%，死亡率上升至6%，屠宰淘汰率增加至1%。
飼料禁抗后，肉雞腸道細菌病將會更加凸顯，其中由產氣莢膜梭菌引起的壞死性腸炎對肉雞危害最大。同時，由大腸桿菌、沙門氏菌、彎曲桿菌等致病菌引起的腸道疾病，也會影響肉雞的生產性能，還會通過食源性傳播威脅人類的健康。以下就肉雞腸道細菌病防控作詳細的闡述。
1. 腸道細菌病
1.1
壞死性腸炎
壞死性腸炎病原為產氣莢膜梭菌，為革蘭氏陽性厭氧菌。產氣莢膜梭菌為條件性致病菌，正常情況下，雞只盲腸常在菌，數量較少，小腸有氧環境下不適合梭菌生存。當應激或其他疾病時，產氣莢膜梭菌會快速增值，通過腸道逆蠕動進入小腸，并分泌毒素蛋白，這些毒素蛋白在胰蛋白酶催化作用下，形成毒素，造成小腸纖維素滲出性腸炎，破壞小腸粘膜上皮細胞，影響養分吸收，最終導致毒素進入血液，形成毒血癥，致使肉雞死亡。
產氣莢膜梭菌被證明是壞死性腸炎的病原，通常壞死性腸炎的爆發需要其他的致病因素共同作用。腸道的組織損傷是引發產氣莢膜梭菌感染的有利條件，而腸道寄生蟲特別是球蟲，對腸道上皮組織的破壞嚴重，往往引起產氣莢膜梭菌的繼發感染，造成梭菌-球蟲循環惡化的級聯反應不斷加劇對腸道上皮組織的破壞。球蟲感染的雞群，產氣莢膜梭菌在3天之內就會對腸道造成損傷。與單獨感染產氣莢膜梭菌的雞群相比，這些雞群表現出更嚴重的損傷和較高的死亡率。霉菌毒素也是引發壞死性腸炎的一個常見誘因，一項關于產氣莢膜梭菌感染的實驗研究顯示，在3,000-4,000ppb（低于歐盟最高指導水平5,000ppb）嘔吐毒素污染飼料情況下，嘔吐毒素使壞死性腸炎的發病率從20%上升至47%。嘔吐毒素能顯著降低十二指腸段上皮電阻值和降低十二指腸絨毛高度，造成腸道屏障破壞和腸上皮損傷，導致腸道上皮通透性的增加和飼料中蛋白的吸收減少，從而刺激產氣莢膜梭菌的增殖，促使壞死性腸炎的發生。
1.2
沙門氏菌病
沙門氏菌是世界范圍內引起細菌性食物中毒的主要病原菌，其中腸炎沙門氏菌、雞白痢沙門氏菌、鼠傷寒沙門氏菌是最重要的三個血清型。研究發現鼠傷寒沙門氏菌能利用腸道炎癥與腸道微生物區系競爭，克服定殖抵抗而獲得生長優勢。同時沙門氏菌比共生菌更能抵抗宿主分泌的抗菌物質，從而在與共生菌的競爭中獲得競爭優勢。
雞腸炎沙門氏菌一般感染20日齡以內的雛雞，主要引起肉雞腸炎；雞白痢沙門氏菌主要侵害雛雞，呈急性敗血性死亡，也是目前父母代雞群凈化的主要病原。據王娟等人2010年報道，屠宰的家禽中，雞攜帶沙門氏菌的陽性率高達30-50%。雖然很多育種和制種公司對父母代雞群進行“兩白一支”凈化，但是由于2019年肉雞行情的持續歷史高位，某些專家擔憂在肉雞養殖高利潤的驅使下，沙門氏菌感染和流行被無限的放大，同時在養殖終端沙門氏菌的發病率大幅度提升得到充分的認證。沙門氏菌的防控及凈化工作任重而道遠。
1.3
大腸桿菌病
大腸桿菌是肉雞腸道中的常在菌，可分為致病性和非致病性兩大類；但其中約10-15%的大腸桿菌是潛在的致病血清型。大腸桿菌病是一種條件性疾病，衛生條件差、不良的飼養管理、應激或并發其它病原感染是此病的誘因。
大腸桿菌的致病機理是其感染機體后，首先通過菌毛粘附在腸黏膜或呼吸道黏膜上皮細胞上，大量繁殖并釋放各種毒素，毒素再與宿主細胞發生相互作用，造成各種組織損傷和功能失調，最終造成實質器官的各種炎癥，甚至造成全身性病癥。研究表明：大腸桿菌內毒素損傷動物的免疫機制及內臟器官，尤其是對肝臟產生的損傷作用。同時免疫力低下易導致大腸桿菌的感染，以病毒病為主的免疫抑制病干擾動物免疫應答，除了引起本身固有疾病外，易引起雞群大腸細菌等致病菌繼發感染。
雛雞最易感染大腸桿菌病。大腸桿菌侵害雞體的部位不同導致的臨床癥狀也有很大差異。大腸桿菌侵襲消化道會引起肉雞細菌性腸炎，病雞精神萎靡不振，會出現腹瀉，排黃白色、黃綠色稀薄糞便，肛門附近羽毛污染嚴重等現象，個別雞只出現癱瘓癥狀，從而影響肉雞腸道健康，導致肉雞生產性能下降。
1.4
彎曲桿菌病
彎曲桿菌對人類產生威脅而備受關注；Humphery強調雖然空腸彎曲桿菌普遍被認為是一種存活于腸道內的共生菌，但通過30多年來的有力證據可表明空腸彎曲桿菌對肉雞的腸道健康也會產生危害。Humphery給肉雞攻毒空腸彎曲桿菌的研究數據表明，在受感染的肉雞中，有90%出現了腹瀉，此外死亡率達到40%，試驗組的肉雞最終體重比對照組的大約要低30%。流行病學調查顯示，雞具有很高的帶菌率，不同地區帶菌率存在明顯差異。南方地區部分省市對家禽養殖場的空腸彎曲桿菌流行調查顯示，空腸彎曲桿菌在雞群中的分離率達到12.94%。孫佳霞等研究調查哈爾濱市周邊肉雞場空腸彎曲桿菌感染狀況，發現雞場平均感染率為35.67%。
1.5
腸道菌群失調
腸道菌群失調是由腸道細菌全面攻擊誘發的一種炎癥反應，而不是由單一細菌引發的。它是微生物菌群和黏膜之間復雜的相關作用，引發腸道炎癥和導致腸道形態改變。為參與的細菌群進一步增殖創造有利環境。腸道菌群失調的特點是腸道出現炎癥和小腸絨毛縮短，這會導致動物出現臨床疾病癥狀和/或生產性能降低。臨床上主要表現為泡沫便、橙色糞便和大灘盲腸糞便，飲水量增加，采食量正常或下降，腿病較為常見。
2. 腸道細菌病的防控
2.1
加強飼養管理
飼養管理對現代化、集約化、規模化肉雞養殖企業至關重要。養殖本身就是非常細致的工作。營養上，首先要把控原料關，嚴控飼料原料的霉菌毒素超標情況，尤其是玉米；其次按照肉雞不同生長階段對營養的需求，合理配制飼料，注意飼料顆粒的硬度、粒度及粉料比例。管理上，要注重雞舍內環境的控制，溫度、濕度、通風“三位一體”統籌管理；高溫高濕季節要注重肉雞的體感溫度，寒冷季節要注重雞舍內空氣質量，尤其氨氣濃度和氧氣含量。保持合理的養殖密度，要根據雞群體重及雞舍內環境進行擴群。飲用水也是肉雞腸道細菌病感染非常重要的一環，最好采用深井水、凈化水或離子交換水，定期采用有機酸對水線進行處理，防治細菌污染。研究證實早期飼喂，可通過促進肉雞腸道上皮細胞和杯狀細胞的發育，改善腸道的發育，同時早期飼喂對抗擊環境性致病因子的干細胞的增殖起著重要作用，這在飼料禁抗后，特別重要。希臘研究人員發現限飼有效減緩肉雞壞死性腸炎，產氣莢膜梭菌攻毒后的試驗雞群經限飼可顯著降低壞死性腸炎損害評分，顯著降低小腸pH值、空腸消化物黏度以及盲腸產氣莢膜梭菌數量。任何管理上的疏忽都會對肉雞造成不可挽回的影響。
2.2
健全生物安全
制定并堅持實施生物安全制度是防控傳染病最有效的措施。消滅傳染源，切斷傳播途徑，保護易感動物是防控傳染病的核心。采用全進全出的肉雞飼養制度，凈道污道要徹底分開；每棟雞舍固定飼養人員，飼養人員嚴禁相互串舍；空舍期間要對整個雞場進行全方位的清掃、沖洗和消毒，同時雞舍還需要進行密閉后熏蒸；不要忽略生活區，如宿舍、食堂、辦公室、衛生間等；養殖期間，所有進場人員及車輛要進行消毒，保持雞舍內墊料干燥，堅持定期帶雞消毒和環境消毒。
2.3
提升免疫力
肉雞機體中將近70%的免疫細胞集中在腸道，且多數免疫細胞位于腸道相關淋巴組織中，腸道被稱為機體最大的免疫器官。腸道免疫力與腸道健康密切相關，腸道許多細菌病屬于條件性致病，當腸道免疫健全時，能夠減少因應激因素引起的某些腸道細菌病。腸壁中自然殺傷細胞、粒細胞和巨噬細胞及其分泌的產物構成腸道細菌感染后立即起作用的第一道防線，從而限制病原菌的生長和傳播，從而限制急性期反應；同時腸道的特異性免疫應答后期，巨噬細胞和粒細胞也起到效應細胞的作用，消滅病原體。
腸道中革蘭氏陰性菌的脂多糖與腸道上皮細胞Toll樣受體4（TLR4）相互作用，導致腸道黏膜屏障的破壞，致病菌易位，隨后發生促炎反應，增加促炎細胞因子（IL-6、IL-8和TNF-ɑ）的產生，最終導致嚴重的炎癥反應，引起細菌性腸炎。研究發現，如果通過提升腸道免疫力，抑制該信號傳導途徑，那么細菌性腸炎的危害就會被極大的降低。
免疫增強劑具有提高機體免疫系統功能，增強機體抗病力，減少疾病發生等特點，近幾年引起養殖界的關注和重視，寡糖、真菌或植物多糖、中草藥、微生態制劑、多肽類生理活性物質、及藻類β-葡聚糖等得到國內外專家學者深入的研究。其中β-葡聚糖是一種病原相關分子模式生理活性化合物，存在于潛在病原微生物細胞壁，當β-葡聚糖暴露于腸道時，動物會產生免疫應答。研究發現，β-葡聚糖到達腸道后，被腸道相關淋巴組織中的免疫細胞（如巨噬細胞/樹突狀細胞）表面的受體（Dectin-1、CR 3等）所識別后被吞噬，激活NF-κB信號通路，強化機體的非特異性免疫和特異性免疫應答。同時β-1,3-葡聚糖（艾樂迪?）比β-1,6-葡聚糖更能刺激機體免疫反應，該結果與葡聚糖的分子量和結構形式有一定的關系。
2.4
調控腸道菌群平衡
益生菌被廣泛用于調節腸道菌群平衡。目前，可用于飼料工業的益生菌主要有芽孢桿菌類、乳酸菌類、酵母菌類以及有時候也會使用霉菌類等。益生菌可競爭附著腸道黏膜上，形成屏障，阻止致病菌的附著，來改善家禽腸道微生物菌群組成。益生菌產生酶，參與動物腸道對食糜的消化吸收；有些益生菌還能產生維生素，主要為B族維生素，為動物直接提供營養物質。益生菌細胞壁上的多糖物質能起到增強動物自己免疫力的效果。乳酸菌類益生菌能夠分泌乳酸、乙酸和多種對動物生長促進作用的物。某些益生菌能夠產生具有抗菌活性的分子，如細菌素、抗菌肽，可以靶向特定的病原體，抑制病原體的增殖或致病毒素的產生，甚至直接殺死病原體。研究表明，枯草芽孢桿菌PB6（克洛生?）可顯著降低腸道產氣莢膜梭菌數量，控制和預防肉雞的壞死性腸炎；可顯著減少腸道沙門氏菌和致病性大腸桿菌的數量，增加乳酸菌的數量，改善腸道絨毛形態，降低料肉比，改善肉雞生產性能；同時建明CLS（客戶實驗室服務）研究發現枯草芽孢桿菌PB6對致病性大腸桿菌、空腸彎曲桿菌、金黃色葡萄球菌及李氏桿菌具有一定的抑制效果。枯草芽孢桿菌PB6還具有緩解腸道炎癥的作用
